生物有機肥是以家畜糞便為主料、秸稈或蘑菇渣等為輔料，添加微生物菌制得的肥料，是綠色食品的基肥。以雞糞為例，隨著我國農業產業化的發展，養殖業中養雞規模的不斷壯大，養殖基地的雞糞也逐漸增多，雞糞的自然堆放，如不作無害化處理，將對周邊地區的生態環境造成污染。如直接作為農家肥使用有如下缺點:雞糞堆放處理簡單，蟲卵死亡率低、有惡臭，施用不方便且肥效不穩定。根據對畜禽糞便減量化、無害化、資源化、產業化處理的原則，利用快速分解菌降解并在其發酵過程中產生的高溫，殺死有害病原菌及蛔蟲卵，把不穩定的物質轉化成較穩定的腐殖質配制成生物有機肥料，此方法經濟實用，無二次污染，近年來已成為雞糞資源化利用及保護生態環境的主要措施。

　　滾筒中有機廢物成功的無味堆肥過程取決于幾個因素。其中之一是滾筒本身的轉速，滾筒反應器旋轉很緩慢，這樣可使反應器內部的物料輕輕翻滾。反過來，這種輕柔的翻轉使廢物的每個顆粒都暴露于環境空氣中存在的氧氣中。因此，自然地存在于廢物中的愛好氧氣的細菌會“深入"氧氣，從而以高的速率促進繁殖和分解（食用）廢物。這種高度好氧分解的副產物只是水蒸氣（H2O）和二氧化碳CO2。這些氣體均無氣味無害。所以，排出的堆肥幾乎沒有氣味。滾筒反應器迅速將有機廢物（不超過4至7天）變成堆肥。它嚴格控制堆肥過程的參數。換句話說，這種滾筒反應器為嗜氧細菌提供了很好的環境，使其可以在高氧過程中繁衍并分解材料。生物反應器將快速堆肥大量有機廢物。而且這樣做不會產生有害的浸出液或惡臭。

　　曝氣式堆肥發酵反應器是一種集物料每天定量收集、存儲及發酵腐熟功能為一體的好氧堆肥發酵反應裝置。堆肥是將農業有機廢棄物通過發酵降解成為穩定的、無害的、適合土壤培肥及土質環境修復的有機類肥料的一個過程。現在，農村小規模堆肥大多采用靜態堆肥法，即把有機廢棄物粉碎處理后，滲入調理劑、膨脹劑混合均勻堆成肥堆，使其發酵分解，成為有機肥料。這種堆肥方法，雖然簡單、成本低，但所需時間較長，臭味較難控制，肥料肥力較差。其原因主要是在發酵過程中無法調節物料的溫度和濕度。利用反應器堆肥，它在發酵過程中可運用物料翻堆、曝氣、攪拌、混合、換氣等手段來控制堆肥物料的溫度，調節堆肥物料的濕度，以提高堆肥發酵速度，縮短堆肥周期，實現規模化堆肥生產的目的。