梅花鹿體長125至145厘米，尾長12至13厘米，肩高70至95厘米，體重70至100千克。頭部略圓，顏面部較長，鼻端裸露，眼大而圓，眶下腺呈裂縫狀，淚窩明顯，耳長且直立，頸部長，四肢細長，主蹄狹而尖，側蹄小，尾較短。毛色隨季節的改變而改變，夏季體毛為棕黃色或栗紅色，無絨毛，在背脊兩旁和體側下緣鑲嵌著有許多排列有序的白色斑點，狀似梅花，因而得名。冬季體毛呈煙褐色，白斑不明顯，與枯茅草的顏色類似。頸部和耳背呈灰棕色，一條黑色的背中線從耳尖貫穿到尾的基部，腹部為白色，臀部有白色斑塊，其周圍有黑色毛圈。尾背面呈黑色，腹面為白色。雄性梅花鹿頭上具有一對實角，角上共有4個杈，眉杈和主干成一個鈍角，在近基部向前伸出，次杈和眉杈距離較大，位置較高，常被誤以為沒有次杈，主干在其末端再次分成兩個小枝。主干一般向兩側彎曲，略呈半弧形，眉叉向前上方橫抱，角尖稍向內彎曲，非常銳利。