配液系統主要包括濃配罐、稀配罐、工藝管道、閥門、除菌過濾系統、在線清洗（CIP）、在線滅菌（SIP）等。由于人眼用藥，對無菌或滅菌的要求很高，必須達到GMP標準，除菌過濾系統要求，要初濾1.0um，之后配 0 . 45 um 、 0 . 22 um過濾器。 配液系統可以設計手動控制和觸摸屏PLC自動控制，根據不同的工藝要求，設計不同的控制系統。全自動控制系統，可以設定參數，可以讀取設備上的工藝參數，可以儲存及模擬數據曲線，還可以打印，及進行密碼和權限設定。配液系統可以設計分配功能，能和灌裝機密切配合，可實行自動化控制和切換。 在線清洗（CIP）、在線滅菌（SIP）按照手動和自動兩種工藝進行設計，在PLC觸摸屏能進行手動控制運行程序，程序運行后由PLC控制系統控制進行CIP或SIP，一旦自動控制程序故障，可以人工手動操作對于自動控制部分進行手動復位操作，并手動進行CIP或SIP操作。對系統內的濃配罐、稀配罐及配套的除菌濾器、閥門、管道及檢測裝置等，CIP和SIP為一個完整的系統，操作程序設計為分段清洗（CIP）和分段滅菌（SIP），如濃配罐通向稀配罐的除菌過濾器、管道、閥門等的清洗（CIP）和（SIP），稀配罐通向緩沖罐或灌裝機的除菌濾器、管道、閥門等清洗（CIP）和（SIP）可分別進行。 配液系統的主要控制點如下：

進料方式控制	液體物料通過泵送設備進料，對泵實現開關量及流量控制，也可以配合稱重控制。輔助物料通過人工計量投入。
進料量的控制	液體物料可以通過流量計或者稱重計量，或液位計量。固體物料的計量通過稱重計量。對流量計、稱重模塊、液位計的控制可以實現在線顯示和時時輸出，及自動控制和設定。
無菌水流量控制	通過流量計可以顯示無菌水的流量，通過自控閥和流量計進行流量大小和定量控制。
溫度控制	通過PID調節可以控制設備恒溫，通過溫度傳感器及溫控儀實現溫度時時顯示。升溫可以通過蒸汽流量的大小進行自動控制升溫速度和時間，降溫可以通過冷水機的流量和溫度調節進行控制。
壓力顯示及控制	通過壓力儀表輸出罐內壓力直，罐內壓力可以通過調節進出氣的閥門進行控制。
出料控制	如果直接進行罐裝，出料方式要做成和罐裝匹配可控型，如果要緩存或貯存，可以進行手動控制出料。
設備清洗和滅菌	系統配置全自動CIP在線清洗系統，根據cip清洗系統的程序進行自動全面的清洗和滅菌。
攪拌控制	攪拌系統的控制可以實現轉速和時間的控制，可以保證產品攪拌的均勻。