微波殺菌設備在烘干產品的同時伴隨著消菌滅霉的作用，其原理是微波電磁場的熱效應與生物效應。微波殺菌，物料僅需在85℃左右的微波場中3~5分鐘，即可達到預定的殺菌效果，遠遠超越傳統的殺菌方式，不僅安全無害，同時沒有額外投入。

微波殺菌機整機采用不銹鋼板制造，結實堅固，有的隔熱保溫性能；設備采用隧道式結構，配置PLC系統、冷熱風系統、紅外測溫儀等，實行流水線工作，程度的增強了生產工序的上下游銜接，增加整體工作效率。

微波殺菌設備的優勢特點:

(1)節約能源：常規熱力殺菌往往在環境及設備上存在熱損失，而微波是直接對食品進行作用處理，因而沒有額外的熱能損耗。相比而言，一般可節電30-50%。

(2)均勻：常規熱力殺菌是從物料表面開始，然后通過熱傳導傳至內部。存在內外溫差。為了保持食品風味，縮短處理時間，往往食品內部沒有達到足夠溫度而影響殺菌效果。由于微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內部都同時受到作用，所以消毒殺菌均勻、

(3)便于控制：微波食品殺菌處理，設備能即開即用，沒有常規熱力殺菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率能從零到額定功率連續可調、傳輸速度從零開始連續調整，便于控制。

(4)設備簡單，工藝：與常規消毒殺菌相比，微波殺菌設備不需要鍋爐、復雜的管道系統、煤場和運輸車輛等，只要具備水、電基本條件即可。

(5)是一種由相應電源的微小發生器、波導管理連接器和處理室組成的微波混合系統，經處理的食品保質期可達6個月以上。