譜庫檢索是質譜儀定性分析為廣泛的輔助手段之一。通常GC—MS儀器的數據系統軟件都配有不同的質譜數據庫和譜庫檢索程序。通過SCAN模式（掃描模式）下得到的質譜圖經過與譜庫對比，得到可信度列表（如下圖一），從而推測出相似的物質。
圖一
質譜庫可分商業譜庫和自檢譜庫
一般新置質譜儀會根據客戶需要帶有一兩個質譜庫，這些質譜庫可以是質譜廠家構建出來的標準譜庫，如農殘庫，有機溶劑庫等，也可以是外界科研機構建立的泛用型質譜庫，收集幾十萬種以上物質的質譜數據。
其中以NIST譜庫為廣泛（National Institute of Standards and Technology，美國標準與技術研究院）。NIST每三年更新一次，NIST11,NIST14,NIST17以此類推。05,08版已收錄近二十萬張質譜庫，后續版本譜庫記錄更多。
此外還有PBM(Probabilit)卜BasedMatching，概率匹配)檢索譜庫，即willey質譜數據庫，標準譜圖已超過27萬張，近20萬個化合物。SADITER庫、NISOH庫等等譜庫就不一 一描述.
上述均為通用譜庫，另外還有一些質譜庫，就如我們提到廠家建立的標準譜庫如標準農藥庫(standardPesticideLmrary)內有340個農藥的標準質譜圖；藥物庫(PflegerDrugLibrary)內有4370個化合物的標準質譜圖，包括許多藥物、殺蟲劑、環境污染物及其代謝產物和它們的衍生化產物的標準質譜圖；以及揮發油庫(Es—sentialOilLibrary)，內有揮發油的標準質譜圖。
后用戶還可以根據自己的需要將試驗中得到的標準質譜圖及數據用文本文件保存在用戶自建庫里，以便加以充分利用。這就是創造出適用于自己科研、檢測、質控用的譜庫。
