1．通風：食用菌冷庫是一個缺氧的環境，半個小時的通風，再經0.5～1小時，二氧化碳濃度又恢復常量，故風量不足是個普遍問題。易形成菇帽尖、柄細長的菇體，就是缺氧的標志。菇體只要處在袋內就不怕通風，食用菌冷庫庫內空氣循環對改善菇體狀態是必需的。通風與降濕增溫的矛盾可通過少通勤通或通風噴霧狀水來解決。同時可加噴石灰水來吸收二氧化碳。

2．溫度：現蕾、抑制、伸長三個階段所需溫度為高、低、中。現蕾前的低溫誘導、現蕾期的相對高濕能加速原基發生；抑制期的低溫輔以強風，能改善菇體品質，增加產量；伸長期的低溫亦有助于增加產量，延長存架期，此階段亦要改變不敢通風的傳統管理辦法，因為庫內缺氧明顯，將嚴重影響菇柄加粗及其商品性。

3．濕度：濕度的大小隨溫度變化，低溫高濕、升溫降濕能預防病害發生；高濕利于出菇密，低溫高濕利于增加菇重。