微波烘干作用于物料內的水分子，使其每秒產生24億五千萬次的震動，分子間互相摩擦產生熱量，當物料內的水分子達到一定的溫度，會在微波能的作用下，按照一定的遷移方向，由物料內部向表面遷移再擴散至大氣當中。 微波干燥設備與傳統的干燥設備具有很大的差異，傳統的干燥設備其干燥方法是通過熱傳導，溫度由表面慢慢傳至內部，這樣物料表面的水分開始被干燥，然后逐步由表面向內部干燥。設備主要是采用微波加熱技術，將物料連續平鋪到設備的輸送帶上，然后輸送到微波加熱烘干箱體內瞬間對物料進行加熱，達到到一定溫度之后，水份就開始汽化蒸發以達到快速烘干的效果。

微波烘干機不同于傳統干燥方式，其熱傳導方向與水分擴散方向相同。與傳統干燥方式相比，具有干燥速率大、節能、生產效率高、干燥均勻、清潔生產、易實現自動化控制和提高產品質量等優點。同時，還兼具了對產品進行殺青、滅菌等特點優勢，因此備受客戶青睞。