微波加熱殺菌裝置包括以下部分：1．產生微波的部分，主要由微波發生器，微波導管構成；2．爐體或爐腔部分，用可反射微波的材料制成，能產生微波諧振；3．爐內還有微波攪動或分散裝置；4．密封門部分，可防止微波泄露；5．操作控制部分包括安全連鎖裝置。大批量的生產主要是采用輸送帶式隧道爐。

　　微波殺菌機用于粉狀、顆粒、片狀等食品、藥品、營養品、糧食制品、農副產品、牛肉、肉脯、方便面、速食品、米粉的干燥、殺菌，杏仁、花生、紅棗、桃仁、板栗的烘烤、膨化、殺菌、脫皮，醬菜、鹵味、各種肉制品小包裝的防霉、殺菌、保鮮，還用于科研院校的研究。

　　1. 微波能的熱效應：在一定強度微波場的作用下，食品中的蟲類和菌體會因分子極化現象，吸收微波能升溫，從而使其蛋白質變性，失去生物活性。微波的熱效應主要起快速升溫殺菌作用；2. 微波能的非熱效應：高頻的電場也使其膜電位、極性分子結構發生改變，使微生物體內蛋白質和生理活性物質發生變異，而喪失活力或死亡。在滅菌中起到了常規物理滅菌所沒有的特殊作用，也是造成細菌死亡原因之一。3. 微波殺菌、保鮮是微波熱效應和非熱效應共同作用的結果。因此，微波殺菌溫度低于常規方法，一般情況下，常規方法殺菌溫度要120℃-130℃，時間約1小時，而微波殺菌溫度僅要70℃-105℃，時間約90-180秒。